Non tutti i dubbi sul superbonus sono stati sciolti. Il nuovo comma 13-ter del decreto prevede che "resta impregiudicata ogni valutazione circa la legittimità dell'immobile oggetto di intervento". Ciò significa che, da una parte le modifiche non avranno l'effetto condono su eventuali abusi edilizi presenti; dall'altra la Cilas autodenuncerà l'interessato nel caso gli elaborati grafici rappresentino delle difformità rispetto all'ultimo titolo edilizio. La seconda criticità è relativa alla necessità di aggiornare l'agibilità e, quindi, di presentare una nuova segnalazione certificata.